สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์สุพรรณบุรี จัดตั้งขึ้นเมื่อวันที่ 1 มกราคม พ.ศ. 2524 โดยเช่าอาคารสำนักงาน เลขที่ 620/1 ถ.หมื่นหาญ ต.รั้วใหญ่ อ.เมือง จ.สุพรรณบุรี 72000 ใช้ชื่อว่า " สำนักงานตรวจสอบกิจการสถาบันเกษตรกรจังหวัดสุพรรณบุรี " ต่อมาได้เปลี่ยนชื่อเป็น "สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์สุพรรณบุรี" ในปีงบประมาณ 2526 สำนักงานตรวจบัญชีสหกรณ์สุพรรณบุรี ได้รับงบประมาณให้ดำเนินการก่อสร้าง อาคารสำนักงานบนที่ดินของราชพัสดุตั้งอยู่เลขที่ 3 หมู่ 4 ตำบลรั้วใหญ่ อำเภอเมือง จังหวัดสุพรรณบุรี 72000 โทร.0-3555-5255 โทรสาร.0-3554-5482